Perbandingan Beberapa Metode Isolasi DNA Untuk Deteksi Dini
KOI HERPES VIRUS (KHV) Pada Ikan Mas (Cyprinus carpio)
Koi Herpes Virus atau akrab disebut Virus KHV bertanggung jawab atas musibah kematian masal ikan mas dalam KJA. Hal ini tentu sangat merugikan bagi para pembudidaya yang pada akhirnya menjual sebelum masa panen dan dengan harga yang jauh dari standar. Sedangkan penanggulangan virus ini masih belum diketahui selain memusnahkan ikan terinfeksi, memperbaiki pengelolaan wadah dan meningkatkan daya tubuh ikan.
Koi Herpes Virus dapat di diagnosis dengan metode PCR namun genom harus diisolasi. pengisolasian DNA ada 4 macam yaitu ;
- Kit Ekstraksi DNA (Wizard genomic DNA purification, promega)
- Metode CTAB (Cationic hexadecyl Trimethyl Ammonium Bromide)
- Metode modifikasi CTAB (Cationic hexadecyl Trimethyl Ammonium Bromide)
- Metode ekstraksi DNA dengan Thermal Lysis
dari ke-empat metode di atas metode yang paling sensitif dalam mengisolasi genom ikan mas adalah Metode Isolasi CTAB karena menghasilkan kemurnian dan konsentrasi DNA tertinggi, sedangkan metode yang lebih efektif dan efisien dari segi waktu, pengerjaan dan biaya adalah metode thermal lysis.
Manfaat dari pendeteksian dini virus KHV adalah untuk mencegah dan meminimalisir tingkat kematian ikan. Hal ini tentu sangat menguntungkan dalam menekan angka kerugian pembudidaya. Aquaculturist dapat mempelajari cara ini untuk dapat siaga dalam memonitoring penyebaran Virus KHV, disamping menguntungkan bagi dirinya sendiri monitoring Virus KHV ini juga dapat menguntungkan masyarakat sekitar yang terbantu dengan penghambatan penyebaran virus tersebut di perairan terbuka.
Sebagai Akuakulturist pendeteksian dini penyebaran virus menjadi penting untuk menghindari kematian masal yang berujung pada kegagalan dalam budidaya. Penggunaan metode yang modern ini dapat menggeser ilmu-ilmu tradisional yang kurang pasti. Dengan pemanfaatan teknologi ini mempermudah kita untuk mendapat hasil yang pasti dan akurat tentang apa yang kita teliti.
